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| Question | Answer |
| Wie schreibt man eine DNA- Sequenz? | von 5' Ende nach 3' Ende Kann der + oder - Strang sein |
| Wie erkennt man ein proteinkodierendes Gen? | Anhand der ORFs (Open reading frames) |
| Was ist die reverse transkriptase, wozu wird sie gebraucht? | RNA wird mit rev. transcriptase zu DNA umgewandelt Meist ist DNA stabiler |
| Was machen DNA Polymerase, rev. transkriptase nd RNA Polymerase? | |
| Was ist der Trick der Sanger sequenzierung? | Einfügen der ddNTPS (ohne hydroxylgruppe am 3' Ende) Stoppt den DNA Synthese: Für jede nucleotid base in der wachsenden DNA Kette kann auch ein ddntp hinzugefügt werden. Am Ende entstehen verschiedene Größen an DNA Fragmenten mit verschiedenen Terminierenden Nucleotiden |
| Was kann man über die Auflösung der Sanger Sequenzoerung sagen? | -> begrenzte Leselänge (circa 1000BP) -> mehr ddntps-> bessere Auflösung nach den Primern -> weniger ddntps (längere Stränge) Qualität am Anfang herabgesetzt wegen sich bindenden Primern Qualität am Ende herabgesetzt wegen schwäche des Gels |
| Welche Matrizen-Moleküle können wir per Sanger-Technik sequenzieren | plus und minus Strang |
| Welchen Vorteil hat es für uns Genomforscher, dass die DNA aus zwei Strängen besteht? | -> doppelte Kontrolle -> ermitteln der regionen mit schlechten signalen (Stränge kommen von verscheidenen richtungen) -> Errors in der Sequenz können ermittelt werden |
| Wie können Sequenzen verglichen werden? | Durch Alignment Beide in + oder - Strang form |
| Was ist die Shotgun Sequenzierungsstrategie? | -besonders nützlich für die Sequenzierung großer Genome - |
| Was ist der unterschied zwischen PCR znd sequenzing? | |
| Was ist der unterschied in einem Sequenz Chromatogram bei einem ringförmigen, bzw gradlinigen Molekül? | |
| Welchen Primer kann man zur Sequenzierung eines PCR Produktes verwenden? | Recyclen des Endes des komplimentären Strangs |
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