Al presentarse automáticamente cesaba en su puesto el Capitán General hasta que se comprobara su inocencia o culpabilidad.
La residencia
Era la rendición de cuentas Que se exigía a los funcionarios mayores al término de su gobierno, aunque también podía hacer el funcionario llamado a juicio de residencia en cuyo caso se le separaba de su cargo
Creada el 20 de enero de 1503 era el organismo rector del comercio con las indias registraba bancos supervisaba el oro daba licencia a Los viajeros.
Capitán General
Audiencias
Corregidores y Alcaldes Mayores
Representaba al Rey en jurisdicciones llamados virreinatos
Fue la máxima autoridad y también era nombrado directamente por el Rey
Era un organismo judicial y administrativo Regido por un presidente y compuesto por oidores.
Su principal función era corregir los abusos de los encomenderos contra los indios.
Autoridades locales
El Ayuntamiento, cabildo o comuna estaba formado por vecinos de pleno derecho (propietarios) institución medieval.
El Ayuntamiento de indios fue organizado en los pueblos de indios, tenían funciones judiciales menores.
Los Jueces de milpa eran los encargados de inspeccionar las huertas y sementeras, de urgir a los indios a sembrar y de calcular el tributo por el monto de las plantas en las cosechas en el proceso de producción.
Porcentaje del tributo que se orientaba a sostener al cura doctrinero.
Alcabala
Media Annata
El quinto real
pagado por los indios de manera comunal, los nativos tenían esa obligación en su condición de vasallos del Rey.
Ordenado en 1576 aplicado a los españoles. Era el 2% sobre todas las operaciones de traspaso compraventa herencias etcétera.
Felipe cuarto en 1625 establecía que se descontaba una parte de los sueldos de los funcionarios nombrados por favor real. Se cobraba la mitad del salario en el año
Impuesto pagado a la corona, consistía la quinta parte del monto total de las extracciones mineras. Fue pagado en Guatemala desde los primeros años.
Papel sellado
Se inició el cobro hacia el año de 1638 por Felipe cuarto que aseguraba que de esa manera los documentos públicos y las peticiones estaban aseguradas y que las constancias de resoluciones judiciales títulos no tendrían equívocos.