Introducción

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Bioquímica y Biomedicina Estructura de Macromoléculas y Enzimología (TEMA 01) Flashcards on Introducción, created by Silvia.F on 30/01/2014.
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¿Qué es la Biología Estructural y a qué se dedica? ¿A qué se refiere con que es un enfoque multidisciplinar? La Biología estructural es una rama de la bioquímica, biofísica y biología molecular que se dedida al estudio de la estructura molecular de las macromoléculas biológicas (sobre todo proteínas y ácidos nucleicos). -Es un enfoque multidisciplinar pues está basado en conceptos de biología, química, física y métodos de análisis como cristalografía de rayos X, RMN, microscopía crio-electrónica y computacionales.
¿Relación entre Pasteur y la teoría vitalista? Pasteur fue un defensor de la teoría vitalista, que nos dice que la materia viva contiene una esencia especial. En su caso dijo que la FERMENTACIÓN es la obra química de la vida sin aire.
¿Autores que acaban con esta teoría vitalista y defienden la teoría materialista? (+ fechas). La teoría materialista es aquella en la cual se considera que la química de los procesos biológicos es igual a la química de la materia inanimada. - Wöhler (1828) sintetizó urea a partir de cianato amónico. - Eduard Buchner (1897) realizó un experimento en el cuál observó el proceso de fermentación sin necesidad de células.
Eduard Buchner (1897) realizó un experimento que tiró por tierra la teoría vitalista ¿en qué consistió? Filtró un estracto de levaduras machacado de tal modo que por el filtro no pasasen las células. Obtuvo, sin células, la capacidad fermentativa, gracias a la molécula "zimasa" de naturaleza proteica.
De mayor a menor ¿cuál es la jerarquía en la estructura celular? Célula+orgánulos>Complejos supramoleculares>Macromoléculas>Monómeros.
¿Qué tipos de biomoléculas hay? Las inorgánicas y las orgánicas. Inorgánicas: agua (entre un 50-95%), e iones (K+, Na+,Mg2+, Ca2+, etc) (en un 1%). Orgánicas: derivados de hidrocarburos compuestos por C, H, O, N, S, P.
¿Qué importancia tiene el carbono? (Tres puntos) - Puede participar hasta en 4 enlaces covalentes fuertes. - Es importante por su complejidad y estabilidad estructural. - Permite formar cadenas largas lineales o ramificadas.
Dibuja una tabla donde figuren la familia, estructura, grupo y propiedades de los grupos funcionales.
¿Qué tienen en común y en qué se diferencian los aminoácidos entre sí? ¿Cuántos hay? Los aminoácidos tienen en común que comparten la misma estructura todos excepto por la cadena lateral R que los distingue. Esta cadena lateral varía en tamaño, reactividad, etc. Hay 20 alfa-aminoácidos.
¿Cómo se forman los polipéptidos? ¿Cómo se subdividen? Los polipéptidos se forman por unión por enlaces peptíficos entre aminoácidos. Si son pocos aminoácidos son péptidos (los cuales poseen poca riqueza estructural) y si son muchos aminoácidos son proteínas.
¿Qué características tienen las proteínas? - Tienen una elevada estructuración. - Diversidad de funciones: catalizadoras, elementos estructurales, transmisoras de señales...
¿Qué son los monosacáridos y cómo se clasifican? ¿Ejemplos? Los monosacáridos son azúcares. Se clasifican según: - Su grupo funcional sea un aldehído o una cetona en: aldosas (ribosa, glucosa...) y cetosas (fructosa). - El número de carbonos: triosas, tetrosas, pentosas, hexosas, etc.
¿Qué enlaces podemos encontrar en estas macromoléculas? - Enlace hemiacetal: gracias al cual los monosacáridos pueden ser cíclicos. - Enlace glucosídico: une monosacáridos entre sí.
¿Cómo se clasifican las macromoléculas según el número de monosacáridos? Disacáridos: dos monosacáridos. -Oligosacáridos: menos de veinte monómeros. -Polisacáridos: más de veinte monómeros.
¿En qué se subdividen los polisacáridos? ¿Qué funciones tienen? - Homopolisacáridos: un único tipo de monosacárido. Funciones: estructural (quitina y celulosa) y de almacén de energía (glucógeno y almidón). - Heteropolisacáridos: varios tipos de monosacáridos. Funciones: de reconocimiento celular o señalizadoras.
¿En qué se subdividen los heteropolisacáridos? En proteoglucanos (glucosaminoglucanos) y glucoproteínas.
¿Qué tipo de ácidos grasos hay? ¿Ejemplos? Los ácidos grasos pueden ser saturados o insaturados. Los saturados no poseen dobles enlaces (como el ácido esteárico) y los insaturados poseen dobles enlaces (como el ácido oleico).
¿Cómo se estructuran los lípidos?¿Ejemplos? R1 y R2: ácidos grasos R3: grupo polar (puede ser colina) GLICEROL -Ejemplos: triacilglicerol, fosfatidilcolina, colesterol.
El agua es el medio... (tres puntos). - Donde se desarrolla la vida. - Disolvente de las reacciones bioquímicas. - De transporte de sustancias: nutrientes y sustancias tóxicas.
¿Propiedades del agua? (cuatro puntos) - Posibilita interacciones débiles. - Térmicas. - Polaridad. - Presión osmótica.
¿Cómo es la estructura molecular del agua?¿Debido a qué?¿Qué provoca esto? La estructura molecular del agua es tetraédrica con geometría angular debido a la hibridación sp3 del oxígeno. Esta estructura la hace una molécula polar con cargas positivas en los hidrógenos y negativa en el oxígeno así pues con capacidad para formar puentes de hidrógeno.
Características y tipos de enlaces débiles. Características: - Tienen baja energía de enlace. - Se rompen y forman con facilidad. - Flexibilidad, dinamismo, reconocimiento molecular... Tipos: - Interacciones iónicas. - Enlace de hidrógeno. - Interacciones dipolares. - Fuerzas de van der Waals. - Interacciones hidrofóbicas.
Interacciones iónicas: cómo se dan, de qué dependen y de qué no, a qué dan lugar. Las interacciones iónicas se dan entre átomos/grupos cargados: si es de la misma carga repulsión, sino, atracción. -Depende de las cargas eléctricas, de la polaridad del entorno (en agua 80, en hidrofóbicos mucho menor) y de la distancia. -De lo que no dependen es de la orientación. -Por último, dan lugar a puentes salinos entre macromoléculas que: - Estabilizan el plegamiento. - Intervienen en interacciones moleculares.
¿En qué consisten los enlaces de hidrógeno y de qué dependen? Los enlaces de hidrógeno dependen de la atracción entre el hidrógeno de un grupo polar y el N/O/S de otro grupo polar. Dependen de la distancia y de la orientación. Si el enlace de hidrógeno es lineal será más fuerte que si es angular.
¿Cómo se dan las interacciones dipolares? ¿De qué dependen y de qué no? ¿Qué tipos hay? Las interacciones dipolares se dan entre moléculas/grupos dipolares. Dependen de la distancia pero no de la orientación. Tipos: -Dipolo permanente - Dipolo permanente -Dipolo permanente - Dipolo inducido -Dipolo inducido - Dipolo inducido
Tipos de fuerzas de van der Waals Superposición: repulsión, cercanía: atracción, lejanía: no hay interacción.
Propiedades térmicas del agua. - Capacidad calorífica elevada: modulador de la temperatura. - Calor de vaporización elevado: mecanismo de refrigeración. Según la temperatura el agua estará en estado líquido como una red de moléculas de agua dinámica o en estado sólido como una red de moléculas de agua estática.
El agua como disolvente. Sí: en moléculas hidrófilas como iones (se disuelven por solvatación) o moléculas polares (se disuelven por interacciones dipolo-dipolo o por formación de puentes de hidrógeno). No: en moléculas hidrófobas: se juntan entre sí y alrededor se forman redes de moléculas de agua organizadas llamadas clatratos.
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