FICHAS BIOLOGIA MOLECULAR

Question	Answer
Es la introducción de un fragmento de ADN denominado inserto dentro de una molécula de ADN denominada vector, que puede replicarse de manera autónoma e independiente del genoma de la célula hospedera:	clonación de ADN, o clonación molecular
Se define como una molécula de ADN de doble cadena (DNAds), con capacidad de albergar un fragmento de ADN exógeno (de otro origen).	Un vector
Como se clasifican los vectores:	vectores de clonación y vectores de expresión.
Su finalidad es el almacenamiento de secuencias y la obtención de grandes cantidades del ADN insertado o de la molécula recombinante	Vetores de clonación
Son aquellos cuyo objetivo es producir un tránscrito (ARN) o la proteína producto de ese tránscrito.	Vectores de expresión
Elementos que forman un vector de clonación:	a) Origen de replicación b) Marcador de selección c) Sitio de clonación múltiple
Como se le llama a la introducción de un vector a una célula eucariota	se le denomina transfección
Es una colección de fragmentos de ADN, provenientes del genoma de un organismo, clonados en vectores para facilitar su estudio	Una biblioteca genómica o genoteca
Se definen como aquellos que han sido manipulados genéticamente, insertando un gen que no forma parte natural de su genoma (transgén), con la finalidad de que se incorpore de manera estable, para que pueda heredarse	Animales transgénicos
Se refiere a un gen que es insertado en un genoma o vector genético	Transgén
¿Qué es un vector?	Es una molécula de ADN de doble cadena, con capacidad de albergar un fragmento de ADN exógeno.
¿Cuál es la finalidad de un vector de clonación?	Es el almacenamiento de secuencias y la obtención de grandes cantidades del ADN insertado o de la molécula recombinante.
¿Qué son los vectores de expresión?	Son aquellos cuyo objetivo es producir un tránscrito (ARN) o la proteína producto de ese tránscrito.
Son una herramienta básica en clonación e ingeniería genética; se utilizan entre otros fines para hacer mapas de restricción de plásmidos o genomas.	Enzimas de restricción
Son las enzimas que modifican a los ácidos nucleicos, ya que son capaces de cortar los enlaces fosfodiester que unen los nucleótidos de una cadena de ácidos nucleicos.	Nucleasa
Como se les denomina a las nucleasas que son capaces de cortar el enlace fosfodiester en nucleótidos localizados dentro de la cadena de ácidos nucleicos.	Endonucleasas
Como se les denomina a las nucleasas que son capaces de cortar el enlace fosfodiester en nucleótidos localizados en los extremos de la cadena de ácidos nucleicos.	Exonucleasas
Las enzimas de restricción, que tipo de actividad presentan y de qué origen son.	Endonucleasa y Bacteriano
Como se le conoce a la secuencia de ADN donde son cortados los enlaces fosfodiester por la enzima de restricción.	Secuencia Diana
Este tipo de enzimas de restricción reconocen una secuencia especifica de nucleótidos y hacen un corte aleatorio en la doble cadena en cualquier secuencia del ADN y a una distancia de 1000 pb del sitio de corte.	Tipo I
Este tipo de enzimas de restricción reconocen una secuencia especifica de nucleótidos y hacen el corte de la doble cadena de ADN en el mismo sitio de reconocimiento.	Tipo II
Este tipo de enzimas de restricción reconocen una secuencia especifica de nucleótidos y cortan el ADN de doble cadena fuera de la secuencia diana.	Tipo III
Como se les conoce a los cortes que se generan, porque la enzima corta en cada cadena de ADN entre nucleótidos localizados en posiciones diferentes respecto al eje de simetría de la secuencia diana.	Cortes cohesivos o pegajosos
Como se les conoce a los cortes que se generan, porque la enzima corta en ambas cadenas de ADN sobre un mismo eje.	Cortes romos
Se define como la serie de fragmentos que se generan por el corte con determinadas enzimas, específicos en tamaño y que permiten emplearlos para la caracterización de dicho ADN.	Mapa de restricción
Son las enzimas de restricción obtenidas de diferente especie bacteriana pero que reconocen la misma secuencia diana de ADN y cortan entre diferentes nucleótidos de dicha secuencia.	Isoesquizomeros
Es un conjunto ordenado de genes en una pequeña superficie (10,000 muestras por cm2) el fundamento de esta técnica se basa en la hibridación de ácidos nucleicos y su detección por fluorescencia mediante análisis de imagen	Microarreglos
¿técnica ampliamente usada por su economía y facilidad, además permite buen aislamiento del ADN de buena calidad?	Técnica fenol-cloroformo
¿a qué temperatura deben de conservarse los reactivos y muestras, antes, después y durante el proceso?	4 grados C
¿Cuáles son los métodos de cuantificación de los ácidos nucleicos más utilizados?	espectrofotometría y flurometria
¿se lleva a cabo para desarrollar estudios de expresión génica para el diagnóstico de enfermedades por virus de ARN o validar la clonación del ADN?	extracción del ARN
¿sirve para la purificación de ambos ácidos nucleicos, aunque su uso principal en el aislamiento del ADN genómico y plasmático?	gradiente con bromuro de cesio
¿a qué temperatura el ácido nucleico se debe de mantener hasta su empleo?	– 80 grados C.
Es la posición física donde se ubica un gen en el genoma?	Locus.
Se utilizan como marcadores genéticos para identiﬁcar o relacionar a personas?	Polimorfismo
Estos polimorﬁsmos pueden estar representados por la deleción, inserción o sustitución de una base nitrogenada en la secuencia nucleotídica normal.	Polimorfismo de nucleotido único
Este tipo de polimorfismos se evidencian mediante el uso de enzimas de restricción, que cortarán determinadas secuencias de ADN.	Polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción
Cuando un individuo tiene diferentes formas alelicas en el locus se dice que es:	Heterocigotico
Se le denomina así a la combinación de secuencias en los alelos que se heredan y es única para cada descendiente; el análisis de sus polimorfismos permite obtener un patrón diferente para cada uno.	Huella genética individual
Polimorfismo que es distintivo en el gen MTHRF y genera una enzima termolábil menos activa. Además, produce enfermedad cardiovascular por su baja concentración de folato en plasma:	Cis677Tre
Este método permite identificar a individuos de acuerdo con parentescos por línea materna, ya que todos los hermanos comparten la misma información en su ADN miocondrial:	Marcadores polimórficos mitocondrial
Tipo de polimorfismo que consiste en bases insertadas o suprimidas:	Insertion-delection
Polimorfismo útil para la diferenciación de isoenzimas en el citoplasma celular mediante la diferenciación de mutaciones no sinónimas de ADN:	Polimorfismo de proteínas
Se define como la transferencia o introducción de material genético a una célula eucariota con el propósito de alterar el curso de una enfermedad o corregir una alteración metabólica o genética.	Terapia génica
Manipulación genética que consiste en insertar un gen funcional que exprese la proteína terapéutica en el tejido indicado.	Adición génica
Tiene el objetivo de disminuir o anular la expresión de algún gen o genes a través de ARN de ARNi, oligonucleótidos o ribozimas.	Supresión génica
Tipo de terapia génica que consiste en la introducción directa del gen terapéutico al torrente sanguíneo del paciente que llegará al órgano blanco.	Terapia génica in vivo
Terapia génica que trata de una microinyección que introduce el ácido nucleico directamente a la célula, para lograr la obtención de organismos recombinantes.	In situ
Se le denomina así a la transferencia de genes por un vector viral.	Transducción
Se le denomina así a la transferencia de genes por un sistema no viral.	Transfección
Es el método para la transfección de células vegetales, que se le conoce como pistola de genes y consiste en el uso de aparato de balística que dispara macropartículas de oro, rodeadas de ADN plasmidico.	Bombardeo de partículas
Esta técnica se basa en el uso de moléculas lipídicas de carga neta altamente positiva que interactúan con el esqueleto fosfatado de la molécula de ADN.	Liposomas
Consiste en la inyección directa de ADN en el núcleo celular mediante una microjeringa y un micromanipulador para introducir el material genético a una célula blanco.	Microinyección
Mecanismo que involucra el empleo de secuencias de ARN de doble cadena para un gen específico, con la finalidad de bloquear su expresión:	ARN de interferencia
La transferencia de genes por un vector viral se denomina:	Transfección
Vehículos utilizados para la transferencia de genes a células somáticas:	Vectores no virales y virales
Todos son virus que se utilizan como vectores en la terapia génica, excepto:	Reovirus
Son virus de doble cadena de ADN, de la familia Herpesviridae, el género más usado como vector es Simplexvirus:	Herpesvirus
Tipo de virus que tiene la ventaja de generar baja respuesta inmune:	Adenoasociado
¿Conjunto de pares de bases contenidas en el ADN de cada organismo?	Genoma
Contiene la información necesaria para el diseño de las estructuras celulares y para todas las funciones que realizan las células.	Los genes
Permite la predisposición de las personas a desarrollar ciertas enfermedades.	Los genes
¿Cuáles fueron los motivos que propiciaron el Proyecto del Genoma Humano?	Conocer la información de la que estamos formados los seres humanos.
¿Por qué el genoma humano se considera patrimonio de la humanidad?	Porque es la base fundamental de la especie humana, para proteger la información contenida en el genoma de su comercialización, y evitar satisfacer intereses individuales y egocentristas.
Mencione las principales aportaciones del Proyecto del Genoma Humano a la medicina.	Se busca principalmente encontrar la relación entre el gen y la enfermedad con el propósito de atacar a la enfermedad antes de que esta se presente, también la creación de medicamentos personalizados de acuerdo a la carga genética del paciente para un mayor beneficio.
¿Cuál es el problema de realizar las pruebas diagnosticas basadas en el análisis del ADN?	Principalmente la discriminación por la salud genética de la persona como en el ambiente laboral, compañías de seguros etc.
¿Cuál es la ventaja de la terapia génica?	Prevenir la expresión de genes implicados directamente en el desarrollo de enfermedades, malformaciones e impedimentos, y el remplazo de genes defectuosos por sanos.
¿Cuál es el problema de crear organismos transgénicos?	El hecho de mezclar la información genética de varias especies para crear nuevos seres transgénicos o una nueva especie humana
Es un método de secuencia con que depende de la degradación química del ADN, tiene la ventaja que puede emplear ADN de doble hebra, requiere de fragmentación del mismo:	Método químico o de degradación de maxam y gilbert
Etapas del método químico o de degradación de maxam y gilbert:	La modificación de una base, eliminación de la base modificada, rotura de la cadena de ADN en la desoxirribosa modificada y el análisis de la secuencia fragmentada por electroforesis en gel poliacrilamida
Modo de uso del método químico de maxam y gilbert:	Puede usarse para matear modificaciones de ADN, producidas por carcinogenos, antineoplasicos y otros agentes que tienen como blanco el ADN
Este proceso consiste en encontrar diferentes cadenas, tantas como número de bases tenga el fragmento que son copias de la cadena de ADN que se va a secuenciar, de tamaño diferente y con la incorporación de 2’ 3’ didesoxinucleótido:	Método didesoxi de Sanger
Permite aumentar la velocidad de secuenciacion y faculta al investigador para analizar un gran grupo de fragmentos de ADN:	Secuenciacion multiplex
Sistema basado en el método enzimatico, que aprovecha la liberacin de pirofosfato cuando un nucleotido se incorpora en la hebra de ADN en crecimiento, mediante bioluminiscencia:	Pirosecuenciacion
Es una herramienta que sirve para el entendimiento de las bases de los procesos celulares que definen la fisiología y el desarrollo:	Secuenciacion
Son utilizados para capear y cuantificar transcritos a partir de muestras biológicas:	ARN-Sec
¿Que constituyen los microarreglos?	Una distribución ordenada de más de 10 mil especies de cm2 en una pequeña superficie en el cual pueden estudiarse simultáneamente mediante hibridación y puede obtenerse una interpretación instantánea de la expresión de multigenes en un solo análisis
¿En que se basa la hibridación genómica comparativa?	Se basa en la hibridación comparativa por la colocación diferencial entre el tejido con la anomalía y sin ella, a partir del análisis de metafases o de ADN genómico
¿En qué campos se ha diseminado el uso de los microareglos?	Campos e la biología básica, estudio de cáncer, diagnóstico de enfermedades, guías de tratamiento e investigación de nuevos fármacos
La creación de perfi les genéticos por medio de polimorfismos se realiza con:	marcadores o regiones con patrones derepetición definidas.
Según estas reglas el grado en el cual dos secuencias de ADN se complementen o emparejan se le llama homología.	De Chargaff
método ideal para detectar polimorfismos en el ADN, ya que mediante el uso de sondas específicas para identificar secuencias repetidas (VNTR o STR), localiza regiones de hibridación homólogas a una secuencia de interés.	Southern blot
La PCR con enzimas de restricción y electroforesis permite localizar :	secuencias blanco
Puede tener más de dos copias del alelo activo, lo que produce enzimas altamente funcionales con actividad enzimática acelerada:	metabolizador rápido
Gen que codifica para una glucoproteína de membrana clase 2 y se ha asociado con resistencia a la insulina.	ENPP1
Gen que es citocina con funciones biológicas diversas, incluida la respuesta inmune.	IL6
Permite determinar la distribución de los tipos microbianos en determinada población, su patogenicidad y resistencia a trata-mientos o inmunogenicidad.	tipificación de genomas microbianos
Son comunes, los comparten 5 a 20% de las personas, lo que obliga a la búsqueda de combinaciones de loci en reacciones multiplex, para lograr un método adecuado de discriminación e identificación precisa:	Los STR
sólo dan evidencia de probabilidad (mayor o menor) de que el patrón genético analizado sea homólogo o concuerde conel de una persona en particular:	los VNTR
¿Consiste en la migración proporcional de las moléculas a través de un gel u otro tipo de matriz porosa, según su peso molecular?	Electroforesis
¿Es es un dispositivo que permite la generación de un campo eléctrico?	Cámara de electroforesis
¿Para la separación de ácidos nucleicos se usan geles de?	agarosa o acrilamida
¿Para la separación de proteínas se usan geles de?	sólo de acrilamida.
¿Es un polisacárido extraído de algas marinas?	La agarosa
¿Es un polímero sintético, termoestable, incoloro y químicamente inerte?	Geles de aclilamida
Es el resultado de la polimerización química de una mezcla de acrilamida y bisacrilamida.	El gel de poliacrilamida
¿Proporciona el medio para la transmisión de la corriente eléctrica y mantiene el pH sin variaciones mientras se realiza el corrimiento?	Buffer de corrimiento
¿Este amortiguador tiene como en brindar peso, densidad y color a la muestra?	Buffer de carga
¿Tipo de electroforesis en la que la totalidad del gel se cubre con buﬀer de corrimiento?	Electroforesis submarina
Empleada exclusivamente con gel de poliacrilamida, se utiliza para proteínas o ácidos nucleicos de pequeño tamaño.	Electroforesis vertical
¿Es método más común para la electroforesis de ADN?	Gel horizontal de agarosa
¿Funciona como otro iniciador de polimerización?	El TEMED
Se aplica para la identiﬁcación de fracciones proteicas o proteínas particulares por tamaño, sobre todo, para la identiﬁcación de moléculas particulares?	Electroforesis de proteínas
Determina el genotipo de un individuo de acuerdo con los marcadores genéticos analizados	Huella genética
Se necesita identificar para establecer una huella genética	Polimorfismo
Es uno de los principales usos que tiene una huella genética	Estudios de paternidad, criminalística , genética forense etc.
Se realiza con marcadores o regiones con patrones de repetición definida, para determinar el genotipo de un individuo	Perfiles genéticos
Nos sirve para identificar de forma temprana efectos secundarios a fármacos, incompatibilidad o resistencia a terapias y variación en la eficacia de medicamentos:	Polimorfismos en enzimas metabolizadoras
Según las reglas de Chargaff, el grado en el cual dos secuencias de ADN se complementan o emparejan es llamado:	Homología
Método que mediante el uso de sondas específicas permite identificar secuencias repetidas (VNTR o STR) o localizar regiones de hibridación homólogas a una secuencia de interés.	SONTHERN BLOT
Es útil en la identificación de restos humanos, familiares extraviados, pruebas de paternidad, etc.	Polimorfismos para establecer huella genética.
Se considera una de las técnicas más sensibles y específicas de las pruebas moleculares.	Reacción En Cadena De La Polimerasa (PCR)
Esta técnica se basa en una replicación exponencial in vitro de una molécula de ADN genómico (ADNg) o ADN complementario (ADNc), mediante ciclos repetitivos, que constan de tres temperaturas. En cada uno de los ciclos las moléculas se duplican hasta que los reactivos se agotan.	Reacción En Cadena De La Polimerasa (PCR)
Enzima más empleada para la PCR; tiene como función polimerizar una nueva cadena de ADN tomando como molde otra ya existente.	Taq ADN polimerasa
Actúa como cofactor de la ADN polimerasa y se suplementa a una concentración de entre 1.0 y 2.5 mM.	Cloruro de magnesio
En qué dirección inicia la polimerización de la ADN polimerasa:	3´5´
Definen el tamaño del fragmento que se ha de amplificar.	Los primers o iniciadores
Los ciclos de amplificación del PCR constan de los siguientes pasos :	Desnaturalización, alineación y extensión
Permite el rompimiento de los puentes de hidrógeno entre las cadenas del ADN:	Temperatura de desnaturalización
Proporciona las condiciones cinéticas favorables para la unión de los iniciadores con su secuencia complementaria.	Temperatura de alineamiento
En este paso del ciclo ampliaficacion del PCR la enzima polimeriza los dNTPs y forma la cadena complementaria basándose en el molde al cual hibridó el primer correspondiente.	Temperatura de extensión
Esta modalidad de PCR permite detectar la presencia o ausencia de un fragmento de ADN determinado:	Cualitativa
Es aquella PCR en la que el producto se analiza después de 25 a 35 ciclos en el punto previo a la saturación de la reacción, mediante un gel de electroforesis:	En punto final
En esta modalidad se realiza en una muestra de tejido embebida en parafina y permite saber qué tipo celular presente en un tejido expresa un determinado gen o cuál célula está infectada por un patógeno:	In situ
Permite conocer los niveles de expresión de un gen (ARNm) en particular, y normaliza los niveles encontrados de este gen con los encontrados en un gen de expresión constitutiva:	PCR semicuantitativa
PCR en la cual se diseñan primers capaces de hibridar solamente en secuencias con presencia de una mutación, por lo que, en caso de estar ausente, no se produce un producto:	Anidada (nested- PCR)
Ciclo elegido por el usuario de fase exponencial en donde la cantidad inicial de moleculas del gen de interes presentes en una muestra inversamente proporcional a la intensidad de flourescencia:	R= CT (Ciclo de corte o Cyclethreshold)
Esta puede utilizarse para determinar la expresion de los niveles de ARNm de un grupo de celulas o tejidos respecto a una referencia:	R=Cuantificacion Relativa
Procedimiento realizado con un gen control endógeno (constitutivo), para eliminar variabilidad entre muestra y muestra:	R= Normalizacion
Esta tecnica es mas sensible y rapida que otras tecnicas de analisis de la exopresion de genes:	R=Retrotranscripcion (paso previo a la PCR)
Cual es la transcriptasa inversa mas usada?	R=M-MLV (Murine-Moloney leukemia virus)
¿Es el equipo en el cual se realiza la PCR?	Termociclador.
Es necesaria una temperatura de 95°C para la _____________________de la doble cadena de ADN, en el caso del ADN genómico, o el rompimiento de estructuras secundarias, en el ADNc.	desnaturalización
¿consta de las tres temperaturas siguientes: 95°C: desnaturalización por unos 30 segundos, 55 a 60°C: alineación por 30 a 40 segundos y 72°C extensión?	ciclo típico de PCR convencional
En esta fase, la temperatura se encuentra en un rango entre 55 y 60°C, en el cual la mayoría de los iniciadores hibrida:	Alineación.
Se produce a la temperatura óptima para el funcionamiento de la ADN polimerasa empleada, por lo que dependerá ésta para la PCR. En el caso de la Taq polimerasa, la más utilizada es de 72°C:	Extensión.
¿Qué es la clonación?	puede definirse como el proceso por el que se consiguen copias idénticas de un organismo, célula o molécula ya desarrollado, de forma asexual.
¿Cuáles son las Técnicas utilizadas para producir embriones genéticamente idénticos?	-La partición o división de embriones por microcirugía. (horizontal) -La separación y cultivo de blastómeros aislados por métodos enzimáticos o mecánicos. (horizontal) -La transferencia nuclear a partir de células somáticas de adulto o embrionarias o de blastómeros de embriones entre otras células. (vertical)
¿Qué tipos de embriones se utilizan para la producción de gemelos idénticos mediante métodos microqururgicos?	Se utilizan embriones octocelulares, en estado de pre-implantación, el numero máximo de células del embrión no pueden ser superior a 8
¿Qué permite la Clonación por transferencia nuclear de células somáticas?	Permite la producción de individuos genéticamente idénticos originados a partir de un solo donador de núcleos.
¿Qué tipos de células se utilizan en la clonación por transferencia nuclear de células somaticas?	somáticas o no sexuales, y sexuales femeninas (ovocitos).
¿Cómo se obtienen los llama animales Knock Out?	se obtienen inactivando por mutagénesis dirigida un gen clonado que codifica un producto génico ausente o inactivado. En caso de proteínas multiméricas la mutación puede causar la formación de multiméros no funcionales
¿Quién logro el primer raton knock out?	El primer ratón knockout fue producido por Mario R. Capecchi, Martin Evans y Oliver Smithies en 1987–1989, obteniendo por tal logro el Premio Nobel de Medicina en 2007.
¿Qué son los animales transgénicos?	Son aquellos en los que se han introducido secuencias de DNA foráneas de la misma especie o de otras especies, las cuales se heredan y se expresan en el animal fundador y en su progenie.

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