A sus 16 años, ingresó en un convento, "Las Carmelitas Descalzas" de México y permaneció en él cuatro meses, lo abandonó por problemas de salud.
A los 18 entró en un convento de la Orden de San Jerónimo, esta vez definitivamente. Sor Juana Inés de la Cruz prefirió el convento al matrimonio para seguir gozando de sus aficiones intelectuales:
«Vivir sola... no tener ocupación alguna obligatoria que embarazase la libertad de mi estudio, ni rumor de comunidad que impidiese el sosegado silencio de mis libros», escribió.

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Niñez de Sor Juana Inés de la Cruz